Se se quiser dizer que tanto os médicos como as clínicas são convencionados, emprega-se a primeira hipótese. Na segunda, pode-se perceber que a convenção só abrange as clínicas.
Substantivos de géneros diferentes, quando antecedem o adjectivo, levam-no para o plural masculino.
Não basta, contudo, aplicar a regra. Se invertêssemos a ordem dos substantivos («clínicas e médicos convencionados»), também não teríamos a certeza de que as clínicas eram igualmente abrangidas.