Os etimologistas indicam que, salvo muito poucas excepções, os termos terminados em -emia se devem pronunciar: ¦emía¦ e não ¦émia¦. Portanto, recomenda-se, por exemplo, hipocalemia (como anemia).
No entanto, há tendência da língua para esdruxulizar alguns destes termos. Daí, por exemplo, a pronúncia frequente «alcoolémia» e não a correcta alcoolemia (e já entrou na língua, vinda pelo latim, por exemplo, blasfémia, também do grego `blasphemía´). Estamos em presença de mais um caso de oposição entre os vernaculistas e os utentes da língua.
Recomendo que use a pronúncia habitual na sua comunidade culta, mas que, em qualquer dos casos, não ponha acento quando escrever a palavra.
Quanto a gastrointestinal, também é correcto grafar gastrintestinal.   

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