Não conheço nenhum estudo a partir do qual se possa afirmar com rigor quais os erros mais comuns de ortografia.

No entanto, poderei dizer-lhe que os erros de ortografia decorrem normalmente da tentativa de fazer corresponder o que se ouve e se diz ao que se escreve. Como o mesmo fonema pode ter várias realizações gráficas, e os falantes da língua muitas vezes não conhecem a etimologia, não sabem bem que palavra estão a utilizar (se é um verbo, um substantivo, uma contracção de preposição com artigo, etc.), não sabem a flexão das palavras, ou seja, não dominam o essencial da gramática da língua, não estão habituados a ver a palavra escrita e não consultam um dicionário quando têm dúvidas, os erros acontecem.

Destes erros de ortografia, poderei assinalar os decorrentes da confusão no emprego de:
a) s, ss, ç ou c;
b) s ou z;
c) z ou x;
d) x ou ch;
e) g ou j;
f) h;
g) e ou i;
h) o ou u;
i) ão e am (terminações verbais);
j) as consoantes não articuladas "c" e "p": cc, cç, ct, pc, pç, pt;
k) o hífen;
l) palavras e expressões homófonas: conserto e concerto; nós e noz; senão e se não; há, forma do verbo haver, e à, contracção da preposição com o artigo, etc.