Parece ser indiferente, uma vez que descolorar e descolorir são termos sinónimos, significando «perder ou fazer perder a cor».
No entanto, na área da química, é mais comum (segundo o Dicionário Houaiss) a forma descolorar: «promover a descoloração de um produto», em que descoloração significa «processo químico que retira de um produto os pigmentos naturais ou as impurezas coloridas para melhor efeito de cor».
A forma descolorir parece ganhar preferência em situações menos técnicas e mais poéticas, com a acepção figurada de «fazer perder ou perder o brilho, o esplendor, o colorido; afear(-se), desvigorar(-se)».