Peço desculpa de só agora lhe responder.
Em primeiro lugar, é preciso distinguir entre siglas e acrónimos. As siglas não têm plural. Os acrónimos, considerados como tais, podem ter plural, quando são autênticas palavras. O problema é serem ou não já palavras do léxico. Por exemplo, Aurélio regista `óvni´, logo `óvnis´.
Quanto à designação Núcleos Jurídicos, a sua representação numa sigla seria simplesmente NJ, sem pontos nem plural. Não encontrei o termo `Nujur´ nos dicionários que possuo; mas se é usado pela comunidade de juristas, não pode ser ignorado. Considerado como um acrónimo, o termo deve obedecer no plural às regras gramaticais da língua: `Nujures´, por terminar em r.
Ao seu dispor,