Não, não é o que sugere duas vezes, mas... a cozedura...
Biscoito – ou biscouto – provém do latim biscoctus, que significa «cozido duas vezes». José Pedro Machado, no seu Dicionário Etimológico da Língua Portuguesa, aventa a hipótese de o vocábulo provir do francês antigo biscuit (séc. XII), contrariando outros autores mais favoráveis à tese de biscoito ter entrado na língua portuguesa por via do italiano abiscoitar.
José Pedro Machado regista a seguinte frase de 1317, transcrita da obra Descobrimentos Portugueses: «... ao que for por arraiz da Galéé; Oyto libras polo mes / por soldada e por gouernho / e pan bíscoyto e agua».