«Longe vão os tempos onde as pessoas nasciam em casa.»*
Quando se trata de tempo, deve utilizar-se a preposição em e o relativo que: «O dia em que nasceu»; «o momento em que falou das aparições»; «o tempo em que as crianças andavam sozinhas pelos montes».
Portanto: «Longe vão os tempos em que as pessoas nasciam em casa.»
* Reportagem na RTP 1 sobre o centenário do nascimento da irmã Lúcia.