Os dicionários brasileiros Michaelis (que pode consultar através das Ligações, 1.ª página do Ciberdúvidas) e Aurélio registam zoneamento = acto de dividir por zonas específicas, reservadas a certas actividades (o zoneamento de uma cidade).
O Vocabulário Técnico e Crítico de Arquitectura (ed. Quimera, Portugal, 1996) indica zonamento = divisão de uma comunidade em zonas ou distritos na perspectiva das utilizações actuais e potenciais da propriedade imobiliária.
Tanto zonamento (zonar + -mento) como zoneamento (zonear + -mento) são substantivos bem formados.
Zonamento vem do verbo zonar (=dividir em zonas), registado em Portugal e no Brasil, e zoneamento do verbo zonear (com significado semelhante), forma registada no Brasil, mas não nos dicionários portugueses que consultei.
Zonar e zonear provêm do substantivo zona: zona + -ar = zonar; zona + -ear = zonear.
Como pode ver no dicionário da Porto Editora (através das Ligações do Ciberdúvidas), -ar é um sufixo verbal, de origem latina, que entra na formação de verbos derivados de substantivos ou adjectivos e designa uma acção correspondente ao sentido da palavra primitiva (coroar, estudar, pular, profanar); -ear é também um sufixo verbal, de origem latina, que ocorre sobretudo em verbos de sentido frequentativo, derivados de substantivos ou adjectivos (golpear, sapatear, senhorear).