São coisas diferentes. A sintaxe é aquela parte da gramática que estuda as relações das palavras e de outros elementos das orações e das frases entre si. Assim, por exemplo, uma palavra ou um seguimento de palavras pode desempenhar a função de sujeito, complemento directo, etc. A morfologia é a parte da gramática que trata do estudo (-logia) da forma (morfo-) das palavras: formação, flexão, classificação.
   A morfossintaxe é a parte da gramática que estuda simultaneamente as palavras no que respeita à forma e à sintaxe.
   Para melhor compreensão, vejamos a origem destas palavras:
   a) Sintaxe - provém do grego sýntaxis, posição em ordem. Do grego transitou para o latim syntaxis, ordem, disposição das palavras, sintaxe, cujo acusativo é syntaxe(m), donde o português sintaxe.
   b) Morfologia - provém do elemento morfo-, de origem grega, morphé, forma, figura, mais o elemento -logia, também de origem grega: da raiz log- de logos, palavra + -ia, sufixo.