Como dizem os dicionários, o prefixo per- de origem latina significa «através de, acima de, muito». Quanto a pre-, também originado no latim, exprime as ideias de «anterioridade (no tempo e no espaço), superlatividade e superioridade», e liga-se sem hífen (o tracinho de união) ao elemento seguinte. Relativamente ao prefixo pré-, o seu uso é igualzinho ao de pre (sem acento). Cuidado: não confundir palavras assim formadas em português com outras que já herdaram a mesma sílaba pre- (sem acento) de étimos latinos começados por prae-. Pelo sim, pelo não, é sempre melhor consultar um bom dicionário ou vocabulário, pois o assunto é um bocado complicado, como vê.