É difícil dar uma resposta definitiva à sua pergunta, visto que são apresentadas razões para os dois usos.

Se partirmos do princípio que são termos latinos, então, o plural de maior é maiores e o de minor, minores. É assim, aliás, que os classicistas fazem relativamente a estes vocábulos e o que me parece mais correcto.

No entanto, há quem defenda que o uso que se faz destes termos é a partir do Inglês, já que estão a ser usados exactamente na mesma acepção e para designar um sistema de ensino que há muito se encontra em países anglófonos.

E essas pessoas usam o plural inglês, obviamente.