Segundo Antenor Nascentes no seu «Dicionário Etimológico da Língua Portuguesa», citado pelo «Dicionário Onomástico...» de José Pedro Machado, Itapiru (sem acento no u) vem do guarani «i'ta», pedra, e «api'ru», delgada, pedra estratificada. E acrescenta, ainda: «No Brasil, o nome lembra a vitória, em 5 de Abril de 1866, de uma força que tomou a ilha fronteira ao forte de Itapiru, sob o comando do tenente-coronel Carlos de Villagran Cabrita».