Gramaticalmente, ambas estas frases estão inteiramente correctas: «Esperamos ter ajudado a você/ao Sr. ou Srª». Correcto está também o complemento directo regido de preposição: a você / ao Senhor. Estaria igualmente correcto sem preposição.
Quanto às formas de tratamento você e Sr. ou Srª, é que há diferença. Em Portugal, emprega-se você entre pessoas do mesmo nível cultural e, geralmente (mas nem sempre), desde que os falantes se conheçam. Emprega-se o Sr. e a Srª nestas circunstâncias: de nível social inferior para superior ou quando os falantes não se conhecem. Há, porém, zonas do país em que não se admite o tratamento de você entre pessoas estranhas.