Nas frases dadas, vê-se perfeitamente que o que foi contado não foi o prazo, mas os dias que constituem o prazo. Sim... contar o prazo para quê? Todos vemos que o prazo é só um, porque a(s) frase(s) começa(m) assim: «O prazo...» Conclusão: a frase correcta é a primeira: «O prazo de 12 dias corridos, contados da data da comunicação.»