Anexo, do latim `annexu-´ (junção, junto, unido), tem presentemente o sentido de aditamento ligado à parte principal, indispensável para a completar (ex.: `as glândulas sudoríparas são anexos da pele).
Apêndice, do latim `appendice-´ (o que pende, adição), tem hoje frequentemente/freqüentemente a acepção de parte que não se considera essencial (ex.: `tirou o apêndice´).
Na minha opinião, a escolha que o Sr. Professor faz está perfeitamente correcta/correta. Eu, no entanto, incluiria no anexo, também, aditamentos importantes para a compreensão do trabalho, mesmo que não fossem da minha autoria.
Ao seu dispor,