Concordo com a doutrina expendida pelo dr. Peixoto da Fonseca no texto aqui ao lado, mas há aqui um pequeno pormenor que é conveniente levar em conta: em "a maioria" / "a maior parte", está presente o artigo definido no singular, o que nos obriga a pôr o verbo no singular. Em 25% dos alunos ficaram em casa, não está presente o artigo definido. Se estivesse, o verbo teria de ir para o plural: "Os 25% dos alunos ficaram em casa".

Como não está presente podemos dizer "25% dos alunos ficou".

Isto que digo está inteiramente de acordo com a doutrina do dr. Peixoto da Fonseca.

Há, porém, quem afirme o seguinte, como por exemplo Napoleão Mendes de Almeida no seu "Dicionário das Questões Vernáculas" no "Noventa por cento dos homens viajaram":

Quando o predicado é constituído de verbo de ligação ou de locução verbal passiva, o verbo e o predicativo (ou particípio nas locuções passivas) deixam-se influenciar pelo número e pelo gênero do partitivo: "noventa por cento das mulheres dessa tribo são analfabetas."

É claro que, neste caso, o verbo de ligação é "ser", mas no outro é "ficar". Isto, porém, não interessa.

Eis a razão por que parece preferível "…ficaram em casa". Mas, enfim, que cada diga como lhe parecer melhor.