É preferível:

"Informa-nos a Escola de que o professor foi aposentado compulsivamente em 13/03/1999."

"Informou-nos a Escola de que o professor fora aposentado compulsivamente em 13/03/1999." / "Informou-nos a Escola de que o professor tinha sido aposentado compulsivamente em 13/03/1999."

Como sabe, o emprego do pretérito perfeito (foi) e do pretérito mais-que-perfeito do indicativo (fora / tinha sido) depende do contexto. Se a referência é uma oração cuja acção decorre no presente (informa) e nos remete para algo que aconteceu, indicamos o passado com o pretérito perfeito (foi); mas, se se trata de oração que já está no pretérito (informou) e nos remete para o pretérito desse pretérito (o passado anterior), empregamos, então, o mais-que-perfeito (fora / tinha sido).